Prevalence of cryptococcosis in Atlántico, department of Colombia assessed with an active epidemiological search

Abstract INTRODUCTION Cryptococcosis is the second most frequent cause of opportunistic infections in human immunodeficiency virus (HIV) patients in Colombia. We aimed to determine the prevalence of cryptococcosis in the Colombian department of Atlántico. METHODS An active search for cryptococcosis cases was conducted between 2015 and 2017 in health institutions by distributing surveys to clinicians and characterizing samples phenotypically and genotypically. RESULTS Thirty-eight cryptococcosis cases were identified (81.6% men, 76.3% HIV patients). The calculated annual prevalence was 5.08/1 million inhabitants. Cryptococcus neoformans var. grubii VNI was isolated in 34 cases. CONCLUSIONS These results provide the basis for passive surveillance of cryptococcosis.

Fatal Cryptococcus gattii genotype VGI infection in an HIV-positive patient in Barranquilla, Colombia

ABSTRACT Cryptococcosis is a major invasive fungal disease related worldwide with the AIDS population. New reports of HIV/AIDS cases to the national public health surveillance system (SIVIGILA) in Colombia have shown that there is a growing community at risk of contracting cryptococcosis throughout the country who do not have access to ART. Even though the most prevalent species Cryptococcus neoformans is mainly associated with the HIV population, we report a fatal case of cryptococcosis in an AIDS patient in Barranquilla, associated with Cryptococcus gattii VGI, isolated from blood culture.

Cryptococcosis in Atlántico, Colombia: an approximation of the prevalence of this mycosis and the distribution of the etiological agent in the environment

ABSTRACTINTRODUCTION:Cryptococcosis is an invasive disease acquired by inhalation of infectious propagules from the environment. Currently, compulsory notification of the spread of this disease is not required in Colombia. However, reporting of human immunodeficiency virus (HIV)/acquired immune deficiency syndrome cases to the National Surveillance System has suggested that there is a growing population at risk of contracting cryptococcosis. Few studies have described the occurrence of cryptococcosis in Colombia. Therefore, in this study, we examined the pathology of this disease in Atlántico, Colombia and determined the distributions of Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii in the environment.METHODS:Clinical samples/isolates were gathered from cases of cryptococcosis previously diagnosed at health institutions in Atlántico, and surveys were completed by clinicians. The environmental study considered 32 sampling points and three tree species, i.e., Quickstick ( Gliricidia sepium ), Almond ( Terminalia catappa ), and Pink trumpet ( Tabebuia rosea ). Environmental and clinical samples/isolates were analyzed for phenotypic and genotypic confirmation.RESULTS:From 1997-2014, 41 cases of cryptococcosis were reported. The mean patient age was 40.5 years (range: 18-63 years); 76% were men, and 78% were HIV positive. Isolation was possible in 38 cases ( C. neoformans , molecular type VNI in 37 cases and C. gattii , molecular type VGI in one case). In 2012-2014, 2,068 environmental samples were analyzed with a positivity of 0.4% ( C. neoformans , molecular type VNI) in Almond and Pink trumpet trees.CONCLUSIONS:Cryptococcus neoformans , molecular type VNI had a higher prevalence than C. gattii and was associated with human exposure and the pathogenesis of cryptococcosis in this geographical region.

Cryptococcosis in Colombian children and literature review

Cryptococcosis is reported in adults and is often acquired immune deficiency syndrome (AIDS)-associated; however, its frequency in children is low. Based on the National Survey on Cryptococcosis conducted in Colombia, an epidemiological and clinical analysis was performed on cases of the disease observed in children less than 16 years old between 1993-2010. We found 41 affected children (2.6% prevalence) from the 1,578 surveys received. The country mean annual incidence rate was 0.017 cases/100,000 children under 16 years, while in Norte de Santander the incidence rate was 0.122 cases/100,000 (p < 0.0001). The average age of infected children was 8.4 and 58.5% were male. In 46.3% of cases, a risk factor was not identified, while 24.4% had AIDS. The most frequent clinical manifestations were headache (78.1%), fever (68.8%), nausea and vomiting (65.6%), confusion (50%) and meningeal signs (37.5%). Meningitis was the most frequent clinical presentation (87.8%). Amphotericin B was given to 93.5% of patients as an initial treatment. Positive microbiological identification was accomplished by India ink (94.7%), latex in cerebrospinal fluid (100%) and culture (89.5%). Out of 34 isolates studied, Cryptococcus neoformans var. grubii (VNI 85.3%, VNII 8.8%) was isolated in 94.1% of cases and Cryptococcus gattii (VGII) was isolated in 5.9% of cases. These data are complemented by a literature review, which overall suggests that cryptococcosis in children is an unusual event worldwide.

Cryptococcosis in Colombia: Results of the national surveillance program for the years 2006-2010 / Criptococosis en Colombia: resultados de la encuesta nacional, 2006-2010

Introduction: A survey on cryptococcosis is being conducted regularly in Colombia since 1997. We present hereby the results corresponding to patients diagnosed from 2006 to 2010. Objective: To analyze the data obtained during this period. Materials and methods: Retrospective analysis of the corresponding surveys. Results: A total of 526 surveys originating from 72% of the Colombian political divisions were received during the 5-year period. Most patients (76.6%) were males and 74.9% were 21-50 years old. The most prevalent risk factor was HIV infection (83.5%) with cryptococcosis defining AIDS in 23% of the cases. In the general population the estimated mean annual incidence rate for cryptococcosis was 2.4 x 106 inhabitants while in AIDS patients this rate rose to 3.3 x 103. In 474 surveys stating clinical features, most frequent complaints were headache 84.5%, fever 63.4%, nausea and vomiting 57.5%, mental alterations 46.3%, meningeal signs 33.0%, cough 26.4% and visual alterations 24.5%. Neurocryptococcosis was recorded in 81.8% of the cases. Laboratory diagnosis was based on direct examination, culture and latex in 29.3% cases. From 413 Cryptococcus isolates analyzed, 95.6% were identified as C. neoformans var. grubii, 1% C. neoformans var. neoformans, and 3.4% C. gattii. Treatment was reported for 71.6% of the cases with amphotericin B alone or in combination with fluconazole prescribed in 28%. Conclusions: Surveys done through passive surveillance continue to be sentinel markers for HIV infection and represent a systematic approach to the study of opportunistic problems regularly afflicting AIDS patients since cryptococcosis requires no compulsory notification in Colombia.

Introducción. Desde 1997 se viene realizando un programa nacional de vigilancia sobre la criptococosis en Colombia. Se presentan los resultados correspondientes a los pacientes diagnosticados entre el 2006 y el 2010. Objetivo. Analizar los datos obtenidos durante este periodo. Materiales y métodos. Análisis retrospectivo de las encuestas. Resultados. Durante los cinco años mencionados se recibieron 526 encuestas representativas del 72 % de la división política colombiana. La mayoría de pacientes (76,6 %) eran hombres y 74,9 % estaban entre los 21 y los 50 años. El factor de riesgo prevalente fue la infección por VIH (83,5 %), y la criptococosis definió el sida en 23 % de los casos. La incidencia anual promedio en la población general fue de 2,4 por un millón de habitantes mientras que, en pacientes con sida, aumentó a 3,3 por 1.000. En 474 encuestas se informaron manifestaciones clínicas; las más frecuentes fueron: cefalea (84,5 %), fiebre (63,4 %), náuseas y vómito (57,5 %), alteraciones mentales (46,3 %), signos meníngeos (33 %), tos (26,4 %) y alteraciones visuales (24,5 %). La neurocriptococosis se reportó en 81,8 % de los casos. El diagnóstico se hizo por examen directo, cultivo y antigenemia en 29,3 % de los casos. De 413 aislamientos recuperados, 95,6 % fueron C. neoformans var. grubii, 1 % C. neoformans var. neoformans, y 3,4 % C. gattii. En 71,6 % de los casos para el tratamiento se administró anfotericina B y en 28 % se combinó con fluconazol. Conclusiones. La vigilancia pasiva continúa siendo un marcador centinela para la infección por VIH, y constituye una aproximación sistemática al estudio de infecciones oportunistas en pacientes con sida, debido a que la criptococosis no es de notificación obligatoria en Colombia.

Comparación de los hallazgos clínicos y de supervivencia entre pacientes VIH positivos y VIH negativos con criptococosis meníngea en un hospital de tercer nivel / Comparison of Clinical Findings and Survival Among HIV Positive Patients and HIV-Negative with Cryptococcal Meningitis in a Tertiary Care Hospital

Introducción: en Colombia ha sido documentada la incidencia incrementada de la criptococosis, al igual que una alta prevalencia de criptococosis por C. gattii en Cúcuta. Objetivo: hacer un análisis de los pacientes con criptococosis meníngea atendidos en un hospital de tercer nivel de atención en Cúcuta, Colombia, estableciendo diferencias según su estado de portador del VIH. Materiales y métodos: se realizó un estudio retrospectivo de revisión de historias clínicas en donde se evaluaron las características clínicas y los resultados de los pacientes con diagnóstico de criptococosis meníngea durante el periodo de estudio de 15 años (1996-2010). Resultados: se analizaron 90 casos, 63 (70%) VIH positivos y 27 (30%) VIH negativos. La mayoría de los pacientes VIH positivos fueron adultos jóvenes (81% vs 25.9% de los pacientes VIH negativos, p=<0.001). Hubo una alta prevalencia de niños entre los pacientes VIH negativos (29.6 vs 0%, p= <0.001). La relación hombre: mujer fue mayor en los pacientes VIH positivos (3.8 vs 2.4; p= 0.001). No se encontró factor de riesgo en 88.9% de los pacientes VIH negativos. Entre los pacientes VIH positivos la mayoría (76.2%) no recibía terapia antirretroviral, muy pocos (7.9%) tomaban profilaxis con fuconazol y 68.8% tenía <100 células CD4+. La hipertensión intracraneana sin hidrocefalia (83.3 vs 48.0%, p=0.009), los cambios visuales (48.1 vs 20.6%, p=0.02) y la criptococosis extraneural (22.2 vs 6.4%, p= 0.06) fueron más frecuentes en los pacientes VIH negativos. Los pacientes VIH negativos tuvieron mayor número de leucocitos (124.2/ml vs 43.0/ml, p=0.002) y de proteínas (113.6 vs 89.7 mg/dL, p<0.001) en el LCR. C. neoformans var. grubii se aisló con mayor frecuencia en los pacientes VIH positivos (100 vs 40%, p<0.001) y C. gattii predominó en los VIH negativos (60% vs 0%, p<0.001). La TAC de cráneo fue más frecuentemente anormal en los pacientes VIH positivos (73.3 vs 22.7%, p<0.001). La mayoría de los pacientes en ambos grupos recibieron anfotericina B como terapia primaria (96.8% de los VIH positivos vs 85.2% de los VIH negativos). La letalidad hospitalaria fue mayor en los pacientes VIH positivos (49.2 vs 16.0%, p=0.004). Fueron factores de mal pronóstico: la infección por el VIH, la alteración del estado de conciencia, la falta de terapia antirretroviral en los pacientes VIH positivos, las convulsiones y la baja celularidad en el LCR. Las secuelas neurológicas fueron frecuentes en ambos grupos de pacientes (40.6% vs 32.0%) sin existir diferencia significativa. La probabilidad de supervivencia fue significativamente mayor en los pacientes VIH negativos (82% vs 46%, p=0.0066). Conclusiones: la criptococosis tiene una alta morbilidad y mortalidad, especialmente en los pacientes VIH positivos. Es muy alta la prevalencia de criptococosis por C. gattii y de niños en la población VIH negativa. (Acta Med Colomb 2012; 37: 49-61).

Introduction: an increased incidence of cryptococcosis has been documented in Colombia, as well as a high prevalence of Cryptococcus gattii in Cucuta. Objective: to analyze patients with cryptococcal meningitis treated at a tertiary care hospital in Cucuta, Colombia, according to the HIV carrier status. Materials and methods: we performed a retrospective review of medical records in which we evaluated the clinical characteristics and outcomes of patients diagnosed with cryptococcal meningitis during the study period of 15 years (1996-2010). Results: we analyzed 90 cases, 63 (70%) HIV positive and 27 (30%) HIV negative. Most HIV-positive patients were young adults (81.0% versus 25.9% of HIV negative patients, p = <0.001). There was a high prevalence of children among HIV-negative patients (29.6 versus 0%, p = <0.001). The male: female ratio was higher in HIV positive patients (3.8 versus 2.4, p = 0.001). No risk factor was found in 88.9% of HIV negative patients. Among the HIV-positive patients, mos of them (76.2%) were not receiving antiretroviral therapy, very few (7.9%) were taking prophylaxis with fuconazole and 68.8% had <100 CD4 + cells. Intracranial hypertension without hydrocephalus (83.3 versus 48.0%, p = 0.009), visual changes (48.1 versus 20.6%, p = 0.02) and extraneural cryptococcosis (22.2 versus 6, 4%, p = 0.06) were more frequent in HIV-negative patients. HIV-negative patients had higher numbers of leukocytes (124.2 /ml versus 43.0 /ml, p = 0.002) and protein (113.6 versus 89.7 mg/dL, p <0.001) in the CSF. C. neoformans var. grubii was isolated more frequently in HIV-positive patients (100 versus 40%, p <0.001) and C. gattii was predominant in HIV-negative (60% versus 0%, p <0.001). CT skull was more frequently abnormal in HIV-positive patients (73.3 versus 22.7%, p <0.001). Most patients in both groups received amphotericin B as primary therapy (96.8% of HIV positive versus 85.2% of HIV negative). The hospital mortality was higher in HIV positive patients (49.2 versus 16.0%, p = 0.004). HIV infection, altered state of consciousness, lack of antiretroviral therapy in HIV-positive patients, seizures and low CSF cellularity were factors of poor prognosis. Neurological sequelae were common in both groups of patients (40.6% vs 32.0%) without significant difference. The probability of survival was significantly higher in HIV-negative patients (82% vs 46%, p = 0.0066). (Acta Med Colomb 2012; 37: 49-61) Conclusions: cryptococcosis has a high morbidity and mortality, especially in HIV positive patients. The prevalence of Cryptococcus gattii in the HIV negative population and in children is very high.

Histoplasmosis en Colombia: resultados de la encuesta nacional, 1992-2008 / Histoplasmosis: results of the Colombian National Survey, 1992-2008

Introducción. La histoplasmosis está caracterizada por variadas manifestaciones que van desde la afección subclínica a la enfermedad diseminada, y suele presentarse tanto en huéspedes inmunocompetentes como inmunosuprimidos. Como la enfermedad no es de notificación obligatoria en Colombia, se diseñó una encuesta para recolectar información de los casos diagnosticados en el país. Objetivo. El objetivo de este trabajo fue analizar los datos recolectados desde 1992 hasta 2008. Materiales y métodos. La encuesta incluyó datos demográficos, factores de riesgo, manifestaciones clínicas, estudios de imágenes, métodos diagnósticos y tratamiento antifúngico. Los pacientes se agruparon de acuerdo con los factores de riesgo y se compararon los correspondientes hallazgos.Resultados. Se examinaron 434 encuestas provenientes de 20 de los departamentos colombianos. La mayoría (96,1 %) correspondían a adultos, 77 % eran hombres con edad promedio de 38,4 años, y sólo 3,9 % eran niños o adolescentes. En los adultos, 70,5 % tenían sida y 7 % presentaban otra inmunosupresión. Las manifestaciones predominantes fueron fiebre (76,1 %), tos (54,8 %) y síntomas constitucionales (56,8 %). En las radiografías, las anormalidades fueron principalmente infiltrados (65,9 %) y nódulos (17,1 %). El diagnóstico se estableció por observación microscópica de H. capsulatum en 49,6 % casos, por cultivo en 58 % y por pruebas serológicas en 14,6 %. El tratamiento se informó sólo en 52,5 % casos. Conclusiones. Se demostró que la histoplasmosis es frecuente en Colombia, especialmente en grupos de riesgo como son los pacientes infectados con el VIH. El análisis de este número relevante de pacientes permitió establecer comparaciones válidas sobre aspectos de la histoplasmosis en nuestro país.

Introduction. Histoplasmosis, a fungal disorder characterized by a wide spectrum of manifestations that range from subclinical infections to disseminated processes, affects both immunocompetent and immunosuppressed individuals. Histoplasmosis is not a reportable disease in Colombia and consequently, a survey was designed to collect histoplasmosis cases diagnosed in the country. Objective. The aim of this work was to analyze the data collected from 1992 to 2008. Materials and methods. The survey included demographic data, risk factors, clinical manifestations, imaging data, diagnostic methods and antifungal treatment. Patients were grouped according to risk factors and comparisons of the various findings were done. Results. A total of 434 surveys were gathered from 20 of the country’s Departments. Most patients (96.1%) were adults, 77% were males with a mean age of 38.4 years. Only 3.9% were children less than 15 years of age. In the adult population, AIDS was reported in 70.5% of the cases; additionally, in 7.0% patients other immunosuppressive conditions were informed. The most frequent clinical manifestations were fever (76.1%), cough (54.8%) and constitutional symptoms (56.8%). X rays abnormalities were represented mainly by infiltrates (65.9%) and nodules (17.1%). Diagnosis was made by microscopic observation of H. capsulatum in 49.6% patients, by culture in 58.0% and by serological test in 14.6% cases. Antifungal use was recorded in 52.5% cases. Conclusions. Histoplasmosis is frequent in Colombia, especially in certain risk factor groups such as the HIV-infected population. Data collected from this large number of cases has allowed valid comparisons on various aspects of histoplasmosis in Colombia.

Incremento de la resistencia a eritromicina de Streptococcus pneumoniae, Colombia, 1994-2008 / Increase in erythromycin-resistant Streptococcus pneumoniae in Colombia, 1994-2008

Introducción. Streptococcus pneumoniae es un agente comúnmente implicado en enfermedad invasora. Los macrólidos constituyen un tratamiento alternativo para las infecciones por S. pneumoniae resistente a los beta-lactámicos. Sin embargo, la resistencia a macrólidos se ha incrementado a nivel mundial. Objetivo. Determinar la frecuencia de la resistencia a la eritromicina de S. pneumoniae en 15 años de vigilancia y caracterizar fenotípica y genotípicamente los aislamientos resistentes. Materiales y métodos. Se analizaron los datos demográficos de los pacientes, la sensibilidad antimicrobiana y los serotipos de los aislamientos resistentes a la eritromicina, recuperados entre 1994 y 2008. Se determinaron los fenotipos por la técnica del doble disco, y los genotipos, por PCR y PFGE. Todos los aislamientos se recuperaron de enfermedad invasiva y fueron proporcionados por los laboratorios nacionales de salud pública. Resultados. Se recuperaron 3.241 aislamientos invasores; 136 (4,2 %) presentaron resistencia a la eritromicina. La resistencia a la eritromicina se incrementó entre 1994-1996 y 2006-2008, de 2,4 % a 6,9 % en menores de 6 años y, de 3,3 % a 5,7 %, en adultos. Los serotipos más frecuentes fueron 6B (36,8 %), 14 (16,9 %) y 6A (17,6 %). El fenotipo constitutivo cMLSB se determinó en 87 aislamientos; 82 tenían el gen ermB. El fenotipo M se determinó en 46; 45 tenían el gen mefA, tres aislamientos expresaron fenotipo inducible (iMLSB) y un aislamiento presentaba el gen ermB. Por PFGE, se determinó que 50 aislamientos estaban relacionados con clones internacionales, de los cuales, 58 % eran España6B ST90, 26 % eran España9V ST156, 8 % eran Colombia23F-ST338 y 8 % eran España23F-ST81. Conclusiones. Se observó incremento en la resistencia a la eritromicina, relacionada principalmente con el mecanismo de metilación ribosómica y con el clon España6B-ST90 que ha circulado en Colombia desde 1994.

Introduction. Streptococcus pneumoniae is a commonly implicated agent in invasive disease. For infections of S. pneumoniae resistant to beta-lactam, macrolides are an alternative treatment. However, resistance to macrolides has increased worldwide as well. Objective. The frequency of resistance to erythromycin was determined for S. pneumoniae over a 15-year surveillance period, and the resistant isolates were characterized phenotypically and genotypically. Materials and methods. Demographic data of the patients, antimicrobial susceptibility and serotypes were analyzed for 3,241 S. pneumoniae isolates recovered between 1994 and 2008. The phenotypes were determined by the double-disc technique and genotypes by PCR (polymerase chain reaction) and PFGE (pulsed field gel electrophoresis). Isolates were recovered from invasive diseases and were provided by national public health laboratories. Results. Of the 3,241 isolates, 136 were resistant to erythromycin. In the 12-year period between 1994-1996 and 2006-2008, resistance in each 2-year sampling had increased from 2.4% to 6.9% in children under 6 years and from 3.3% to 5.7% in adults. The most common serotypes were 6B (36.8%), 14 (16.9%) and 6A (17.6%). Constitutive phenotype cMLSB was determined in 87 isolates; 82 of these expressed the ermB gene. Phenotype M was determined in 46 isolates; 45 had the mefA gene. An additional three isolates expressed the inducible phenotype (iMLSB), and one expressed the ermB gene. By PFGE, 50 of the isolates were found to be related to international clones--58% were Spain6B-ST90, 26% Spain9V-ST156, 8% Colombia23F-ST338 and 8% Spain23F-ST81. Conclusion. The increase in erythromycin resistance was primarily related to the mechanism of ribosomal methylation. More than half the cases were congeneric with the clone Spain6B-ST90 that has been circulating in Colombia since 1994.

Histoplasmosis localizada del sistema nervioso central en un niño inmunocompetente / Central nervous system localized histoplasmosis in an immunocompetent child

Introducción. La histoplasmosis localizada del sistema nervioso en una forma rara de presentación de estamicosis sistémica. Se puede manifestar clínicamente como una meningitis crónica, lesiones focales encefálicas ode la médula espinal, ataques cerebrovasculares y encefalitis. Caso clínico. Se presenta el caso de un niño inmunocompentente con histoplasmosis localizada del sistema nervioso central. Su cuadro clínico neurológico fue de evolución crónica y presentó varios déficits neurológicos focales. Las imágenes diagnósticas evidenciaron múltiples masas del tallo cerebral y de la médula espinal cervical. Las pruebas inmunológicas demostraron anticuerpos anti Histoplasma. El paciente mejoró con el tratamiento secuencial de anfotericina B y fluconazol. Conclusiones. A pesar de su rareza, la histoplasmosis del sistema nervioso debe estar en el diagnóstico diferencial de las masas múltiples del encéfalo y médula espinal en un paciente residente en área endémica, las pruebas inmunológicas son útiles como herramienta diagnóstica y el tratamiento antimicótico puede llevar a la curación.

Introduction. Localized central nervous system histoplasmosis is a rare clinical form of this systemic mycosis. It could be presented as chronic meningitis, focal encephalic or spinal cord lesions, stroke syndromes and encephalitis.Clinical case. We present a case of an immunocompetent child with localized histoplasmosis of the central nervous system. The neurological case had a chronic evolution and presented several focal neurological deficits. Magnetic resonance imaging showed multiple masses of the brainstem and the cervical spinal cord. Immunologicaltests showed antibodies anti-Histoplasma capsulatum. The clinical condition of the patient improved with the sequential treatment with amphotericin B and fluconazole.Conclusions. In spite of the rare presentation, central nervous system histoplasmosis should be considered inthe differential diagnosis of multiple brain and spinal cord lesions in a patient resident in an endemic area. Immunological tests are useful as a diagnostic tool and the antifungal treatment could lead to cure.

Resistencia a antibióticos no betalactamicos de aislamientos invasores de streptococcus pneumaniae en niños latinomaricanos: Sivera II, 200-2005 / Resistance to beta-lactam antibiotics are not invasive isolates of streptococcus latinomaricanos pneumaniae in children: Sivera II, 200-2005

Determinar la evolución de la esistencia a la eritromicina, el cloranfenicol, el trimetoprim-sulfametozaxol (SXT) yla vancomicina de aislamientos invasores de Streptococcus pneumoniaeobtenidos de niños de 10 países de América Latina y del Caribe en seis años de vigilancia.

Circulation of Streptococcus pneumoniae clone Colombia5 ST289 in nine Latin American countries / Circulación de Streptococcus pneumoniae clon Colombia5 ST289 en nueve países de América Latina

OBJECTIVE: To determine genetic relatedness of clone Colombia5 ST289 with invasive Streptococcus pneumoniae serotype 5 isolates recovered in nine Latin American countries. METHODS: Forty-four invasive S. pneumoniae serotype 5 isolates recovered from children under 5 years of age in Bolivia, Chile, Dominican Republic, Ecuador, Nicaragua, Panama, Paraguay, Peru, and Venezuela were studied. Pulsed-field gel electrophoresis patterns of DNA treated with SmaI restriction enzyme were classified using Tenover's criteria and analyzed with the Fingerprinting II program to determine their genetic relatedness with the Colombian clone. RESULTS: All isolates had a genetic similarity of 78.5 percent or more with the Colombian clone. Thirteen electrophoretic subtypes derived of pattern A were identified, and five of them (A5, A6, A8, A13, A27) comprised 61.4 percent of the isolates. CONCLUSIONS: Clone Colombia5 ST289 is disseminated in Latin America. This is important because S. pneumoniae serotype 5 frequently causes invasive disease in the region and is associated with trimethoprim-sulfamethoxazole resistance.

OBJETIVO: Determinar la relación genética del clon Colombia5 ST289 con los aislamientos invasores de Streptococcus pneumoniae serotipo 5 provenientes de nueve países latinoamericanos. MÉTODOS: Se estudiaron 45 aislamientos invasores de Streptococcus pneumoniae serotipo 5 procedentes de niños menores de 5 años de Bolivia, Chile, Ecuador, Nicaragua, Panamá, Paraguay, Perú, República Dominicana y Venezuela. Los patrones en electroforesis en gel de campo pulsante del ADN tratado con la enzima de restricción SmaI se clasificaron mediante el criterio de Tenover y se analizaron con el programa Fingerprinting II para determinar su relación genética con el clon colombiano. RESULTADOS: Todos los aislamientos tuvieron una similitud genética de 78,5 por ciento o mayor con el clon colombiano. Se identificaron 13 subtipos electroforéticos derivados del patrón A y cinco de ellos (A5, A6, A8, A13 y A27) constituyeron 61,4 por ciento de los aislamientos. CONCLUSIONES: El clon Colombia5 ST289 está diseminado por América Latina. Esto es importante ya que S. pneumoniae serotipo 5 es causa frecuente de enfermedades invasoras en la Región y está asociado con la resistencia a trimetoprim-sulfametoxazol.

Caracterización de aislamientos invasivos de S. pneumoniae, H. influenzae y N. meningitidis en América Latina y el Caribe: SIREVA II, 2000-2005 / Characterization of invasive isolates of S. pneumoniae, H. influenzae, and N. meningitidis in Latin America and the Caribbean: SIREVA II, 2000-2005

OBJETIVOS: Analizar las características fenotípicas y la susceptibilidad a antibióticos de las cepas circulantes de Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae y Neisseria meningitidis en América Latina y el Caribe entre 2000 y 2005. Se evaluó la cobertura potencial de las vacunas conjugadas. MÉTODOS: Se estudió por métodos convencionales la distribución de los serotipos o serogrupos de 17 303 cepas de S. pneumoniae, 2 782 cepas de H. influenzae y 6 955 cepas de N. meningitidis aisladas de casos de neumonía, meningitis, sepsis, bacteriemias y otros procesos invasivos. Se evaluó la susceptibilidad a los antibióticos de las cepas estudiadas. Los aislamientos procedían de 453 centros centinelas de 19 países de América Latina y 4 del Caribe, como parte del proyecto SIREVA II. RESULTADOS: El serotipo 14 de S. pneumoniae fue el más frecuentemente aislado (21,1 por ciento), especialmente en niños menores de 6 años (29,1 por ciento). Las coberturas potenciales de las vacunas conjugadas antineumocócicas hepta, nona, deca y tridecavalentes fueron de 59,0 por ciento, 73,4 por ciento, 76,5 por ciento y 85,9 por ciento, respectivamente. De los aislamientos, 63,3 por ciento eran sensibles a la penicilina. El serotipo b de H. influenzae estuvo presente en 72,2 por ciento de los aislamientos en niños menores de 2 años, mientras 8,6 por ciento correspondieron a los serotipos a, c, d, e y f; 19,2 por ciento resultaron no serotipables. La proporción de cepas de H. influenzae productoras de betalactamasa en aislamientos en niños menores de 2 años fue de 16,3 por ciento. Los serogrupos de N. meningitidis más frecuentes fueron el B (69,0 por ciento) y el C (25,7 por ciento); 65,8 por ciento y 99,2 por ciento de las cepas fueron sensibles a la penicilina y a la rifampicina, respectivamente. CONCLUSIONES: Estos resultados resaltan la importancia de la vigilancia epidemiológica integral de S. pneumoniae, H. influenzae y N. meningitidis en América Latina...

OBJECTIVES: To analyze the phenotypical characteristics and the susceptibility to antibiotics of the circulating strains of Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, and Neisseria meningitidis circulating in Latin America and the Caribbean from 2000-2005. Potential coverage by conjugate vaccines was evaluated. METHODS: Conventional methods were used to study the distribution of the serotypes or serogroups of 17 303 strains of S. pneumoniae, 2 782 strains of H. influenzae, and 6 955 strains of N. meningitidis isolated from cases of pneumonia, meningitis, sepsis, bacteriemias, and other invasive processes. The antimicrobial susceptibilities of the study strains were evaluated. The isolates came from 453 sentinel surveillance sites in 19 countries in Latin America and four in the Caribbean, as part of the SIREVA II (Network Surveillance System for the Bacterial Agents Responsible for Pneumonia and Meningitis) project. RESULTS: S. pneumoniae serotype 14 was the most frequently isolated (21.1 percent), especially in children under 6 years of age (29.1 percent). The potential coverages by hepta-, nona-, deca-, and trideca-valent antipneumonia conjugate vaccines were 59.0 percent, 73.4 percent, 76.5 percent, and 85.9 percent, respectively. Of the isolates, 63.3 percent were sensitive to penicillin. H. influenzae serotype b was present in 72.2 percent of the isolations from children under 2 years of age, whereas 8.6 percent produced serotypes a, c, d, e, and f, and 19.2 percent could not be serotyped. The rate of H. influenzae beta-lactamase-producing strains isolated from children under 2 years of age was 16.3 percent. The most frequent N. meningitidis serogroups were B (69.0 percent) and C (25.7 percent); 65.8 percent and 99.2 percent of the strains were susceptible to penicillin and rifampicin, respectively. CONCLUSIONS: These results highlight the importance of comprehensive epidemiological surveillance of S. pneumoniae, H. influenzae...

Perfiles de resistencia a fluoroquinolonas en aislamientos clínicos de cocos Gram positivos provenientes de hospitales colombianos, 1994-2004 / Resistance profiles to fluoroquinolones in clinical isolates of Gram positive cocci

Introducción. Las fluoroquinolonas son antibióticos de amplio espectro comúnmente utilizados en el manejo de infecciones. Objetivo. Determinar los patrones de resistencia a fluoroquinolonas en aislamientos colombianos de Streptococcus pneumoniae, Staphylococcus aureus, estafilococos coagulasa negativa y enterococos de centros hospitalarios colombianos, recolectados entre 1994 y 2004. Materiales y métodos. Se realizó la determinación de concentraciones inhibitorias mínimas frente a ciprofloxacino, moxifloxacino y gatifloxacino a 270 aislamientos clínicos de S. pneumoniae, 348 de S. aureus, 176 de estafilococos coagulasa negativa y 123 de enterococos. Para los aislamientos de S. aureus resistentes a la meticilina se determinó la concentración inhibitoria mínima frente a levofloxacino y para aislamientos de S. pneumoniae se realizó la prueba de difusión en agar con discos de ofloxacino y levofloxacino. Resultados. Doscientos sesenta y nueve (99,6 por ciento) aislamientos de S. pneumoniae fueron susceptibles a gatifloxacino y moxifloxacino; para levofloxacino y ofloxacino la resistencia fue del 1,5 por ciento y 8,9 por ciento, respectivamente. El 15,9 por ciento de S. pneumoniae tuvo una concentración inhibitoria mínima ³ ³³ ³³4 µg/ml frente a ciprofloxacino. Las prevalencias de resistencia para ciprofloxacino, gatifloxacino y moxifloxacino en los 348 aislamientos de S. aureus fueron 55,4 por ciento, 54,9 por ciento y 52,6 por ciento, y en S. aureus resistentes a meticilina, fueron 92,3 por ciento, 91,3 por ciento y 87,5 por ciento y 91,8 por ciento para levofloxacino. En estafilococos coagulasa negativa y enterococos susceptibles a vancomicina se observaron tasas de resistencia entre 25,6 por ciento y 31,8 por ciento. Todos los aislamientos de enterococos resistente a vancomicina fueron resistentes a los compuestos evaluados. Conclusión. Los aislamientos colombianos de S. pneumoniae mantienen susceptibilidad a las fluoroquinolonas de última generación. La...

Caracterización de un brote de infección por Acinetobacter baumannii en una unidad de cuidado crítico en Bogotá, Colombia / Characterization of an outbreak infection caused by Acinetobacter baumanni in an intensive care unit, in Bogotá, Colombia

Objetivo: caracterización de un brote de infección por Acinetobacter baumannii y determinación de los factores asociados. Diseño: estudio de casos y controles anidado en una cohorte de pacientes críticos entre octubre de 2003 y marzo de 2004. Criterios de inclusión: haber estado hospitalizado en la unidad de cuidados intensivos en el mismo periodo y ser sometidos a procedimientos invasivos. Se excluyeron los pacientes que fallecieron en las primeras 24 horas de haber ingresado a la unidad de cuidados intensivos o que habían sido remitidos de otras instituciones. Se evaluó edad, sexo, antecedentes de enfermedad crónica, índice de intervención terapéutica (therapeutic index score system, TISS), tiempo de uso de dispositivos invasivos, tipo de nutrición, exposición previa a antibióticos, procedimiento quirúrgico, tiempo de uso de exposición y estancia. La investigación epidemiológica de los aislamientos incluyó la tipificación molecular mediante electroforesis en gel de campo pulsado. Resultados: los aislamientos de A baumannii provenientes de los pacientes infectados y de los cultivos de vigilancia fueron resistentes a múltiples antibióticos. Los aislamientos se encontraron relacionados genéticamente con un porcentaje de similitud mayor del 97 por ciento. Se encontró asociación estadísticamente significativa entre la infección de A. baumannii y un mayor puntaje de intervención terapéutica durante la hospitalización (p=0,030), uso de nutrición parenteral (0=0,030) y tiempo de exposición (p=0,02 super índice 2). Conclusiones: la infección por A baumannii, Se asoció a un mayor índice de intervención terapeútica, al uso de nutrición parenteral y al tiempo de exposición. Los aislamientos se encontraron relacionados genéticamente.

Red Regional de Laboratorios para la Vigilancia de las Infecciones Fúngicas Invasoras y Susceptibilidad a los Antifúngicos / Regional Laboratory Network for Surveillance of Invasive Fungal Infections and Antifungal Susceptibility in Latin America

This article describes the general objectives of the Regional Laboratory Network for Surveillance of Invasive Fungal Infections and Antifungal Susceptibility in Latin America. Formation of the Network was coordinated by the Essential Medicines, Vaccines, and Health Technologies Unit of the Pan American Health Organization, with the technical and financial support of the National Center for Microbiology of the Carlos III Health Institute (Spain), and the technical support of the Microbiology Department of the Dr. C. Malbrán National Institute on Infectious Diseases (Argentina) and the Microbiology Unit of the Parasitology Service of the Adolfo Lutz Institute (Brazil). The Network's principle objectives are epidemiological surveillance of invasive fungal infections through detection of antifungal resistance and identification of emergent, invasive fungal infections; establishment of norms and common protocols for early diagnosis of mycoses; and strengthening coordination, communications, and transference mechanisms among countries. The Network must be gradually implemented and must include staff training, a systematic process for sharing technology, evaluation of diagnostic techniques, identification of fungal species, and standardized tests for antifungal susceptibility.

Identificación de Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae y Neisseria meningitidis por reacción en cadena de la polimerasa / Identification of Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae and Neisseria meningitidis by polymerase chain reaction

Introducción. Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae y Neisseria meningitidis son los principales patógenos humanos causantes de meningitis. Objetivo. Se evaluaron los iniciadores omp2, lytA y crgA en el desarrollo de una reacción en cadena de la polimerasa múltiple, para la identificación simultánea de los tres principales microorganismos responsables de la meningitis bacteriana. Materiales y métodos. Se evaluaron en un formato de PCR múltiple los iniciadores para la proteína de membrana externa ( omp2, 1.000 pb) de H. influenzae, la autolisina A ( LytA, 395 pb) de S. pneumoniae y el gen regulador de contacto A ( cgrA, 230 pb) de N. meningitidis y se determinó la sensibilidad y la especificidad de la técnica. Resultados. Se obtuvieron resultados reproducibles con una concentración de 50 nM de cada uno de los tres iniciadores y una temperatura de anillamiento de 57°C obteniendo una sensibilidad de 12,5 fg para H. influenzae y S. pnemoniae y de 3,12 fg para N. meningitidis. No se presentaron reacciones cruzadas con otros microorganismos causantes de meningitis o relacionados con los géneros. Conclusión. Los resultados de sensibilidad y especificidad sugieren que los iniciadores evaluados pueden ser utilizados para el desarrollo de una PCR en formato múltiple que permita la identificación de los tres principales patógenos causantes de meningitis.

Introduction: Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae and Neisseria meningitidis are the main human pathogens that cause meningitis. Objective: Primers omp2, lytA and crgA were evaluated with H. influenzae, S. pnumoniae and N. meningitidis DNA in a multiplex PCR, determining the sensitivity and the specificity of the technique. Materials and methods: Primers for H. influenzae outer membrane protein (omp2, 1000 pb), S. pneumoniae autolysin (lytA, 395 pb) and N. meningitidis, contact regulated gene (crgA, 230 pb) were evaluated in a multiplex PCR, determining the sensitivity and the specificity of the technique. Results: Reproducible results were obtained with 50 nM of each of the three primers and annealing temperature of 57oC in the multiplex PCR, obtaining a sensitivity of 12.5 fg for H. influenzae and S. pneumoniae and 3.12 fg for N. meningitidis. No cross reactions with other microorganisms agents of meningitis or related with the genera, appeared. Conclusions: The results for sensitivity and specificity suggest that the evaluated primers can be used for the development of a PCR in a multiplex format to the identification of the three main pathogens that cause meningitis.

Estudio clínico y epidemiológico de la criptococosis en Colombia: resultados de nueve años de la encuesta nacional, 1997-2005 / Results of nine years of the clinical and epidemiological survey on cryptococcosis in Colombia, 1997-2005

Introducción. Con el fin de conocer la situación de la criptococosis en Colombia se ha llevado a cabo una encuesta nacional. El presente estudio analiza la información recogida de 1997 a 2005. Materiales y métodos. Se utilizó el formato de encuesta de la Confederación Europea de Micología Médica. Resultados. Se recibieron 931 encuestas de 76 centros. Se identificaron 891 (95,7 por ciento) casos de neurocriptococosis, 27 (2,9 por ciento) de formas pulmonares, cinco (0,5 por ciento) de lesiones cutáneas, dos (0,2 por ciento) de ganglionares, dos (0,2 por ciento) de úlceras orofaríngeas y un caso (0,1 por ciento) de cada una de las siguientes formas clínicas: peritonitis, lesión hepática, celulitis de los miembros inferiores e infección de las vías urinarias. El 82,7 por ciento fueron hombres con predominio de los adultos jóvenes. Sin embargo, se reportaron 25 (2,7 por ciento) niños. La infección por el virus de la inmunodeficiencia humana se encontró en el 78,1 por ciento de los casos. La incidencia promedio anual de criptococosis en la población general fue de 2,4 casos x106, pero en los pacientes con sida se elevó a 3,0 casos x 103. Las manifestaciones clínicas más frecuentes fueron: cefalea (85,2 por ciento), náuseas y vómito (59,1 por ciento), fiebre (59 por ciento), cambios mentales (46,2 por ciento) y signos meníngeos (33,4 por ciento). El examen directo de líquido cefalorraquídeo fue positivo en el 92,8 por ciento de los casos y el hongo se recuperó en el 90,3 por ciento. El antígeno capsular tuvo una positividad del 98,9 por ciento en el líquido cefalorraquídeo y del 93,7 por ciento en el suero. De 788 aislamientos remitidos, 95,9 por ciento fueron Cryptococcus neoformans var. grubii serotipo A, 0,3 por ciento, var. neoformans serotipo D, 3,3 por ciento, C. gattii serotipo B y 0,5 por ciento, C. gattii serotipo C. La mayoría de los pacientes fueron tratados inicialmente con anfotericina B. Conclusión: La criptococosis es una enfermedad cuya incidencia a...

Introduction. A national survey on cryptococcosis has been conducted in Colombia since 1997. The survey data recorded over a 9-year period, 1997 to 2005, was summarized. Materials and methods. The format provided by the European Confederation of Medical Mycology was adapted with the correspondent permission. Results. Over the 9 year period, 931 surveys were received from 76 centers. The associated disease syndromes were as follows: 891 (95.7%) were neurocryptococosis cases, 27 (2.9%) pulmonary disease, 5 (0.5%) cutaneous lesions, 2 (0.2%) ganglionar forms, 2 (0.2%) oropharyngeal lesions and one case (0.1%) each from peritonitis, liver lesion, cellulitis and urinary tract infection. Demographic data indicated 82.7% of the subjects were males, and 59.4% were between 20-39 years old; 25 children less than 16 years old were reported. The prevalent risk factor was HIV infection (78.1%). The mean annual incidence rate of cryptococcosis in the general population was 2.4 X 106 inhabitants, but in AIDS patients the rate rose to one in 3 X 103. The most frequent clinical features were headache (85.2%), nausea and vomiting (59.1%), fever (59.0%), mental changes (46.2%), meningeal signs (33.4%), cough (23.6%) and visual alterations or loss of vision (20.9%). Laboratory data showed that direct examination of cerebrospinal fluid (CSF) was positive in 92.8% cases and Cryptococcus was recovered in 90.3% of the cases. Cryptococcal antigen reactivity was 98.9% in CSF and 93.7% in serum samples. From 788 isolates submitted, 95.9% were C. neoformans var. grubii serotype A, 0.3% var. neoformans serotype D, 3.3% C. gattii serotype B and 0.5% C. gattii serotype C. The majority of patients were treated initially with amphotericin B. Conclusion. Cryptococcosis incidence has increased dramatically in Colombia with the AIDS pandemic and it can be considered as a sentinel marker for HIV infection.

Caracterización molecular de aislamientos invasores colombianos de Streptococcus pneumoniae serotipo 5 recuperados entre 1994 y 2004 / Molecular characterization of Colombian invasive serotype 5 Streptococcus pneumoniae isolates recovered between 1994 and 2004

Introducción. Streptococcus pneumoniae serotipo 5 es causa importante de enfermedad invasora en Colombia, donde se ha demostrado la circulación del clon 19-Colombia5 susceptible a penicilina pero resistente a tetraciclina y a cloranfenicol. Objetivo. Establecer las relaciones genéticas de aislamientos invasores colombianos de S. pneumoniae serotipo 5 recuperados entre 1994 y 2004 con el clon 19-Colombia5. Materiales y métodos. Se estudiaron 83 aislamientos que tenían datos de susceptibilidad a penicilina, vancomicina, ceftriaxona, eritromicina, trimetoprim sulfametoxazol, cloranfenicol y tetraciclina, de los cuales 29 fueron obtenidos de niños menores de cinco años. El patrón de restricción del ADN se determinó por electroforesis en gel de campo pulsado, usando la enzima Sma I. La similitud genética entre los aislamientos y el clon se estableció según los criterios de Tenover y utilizando el programa fingerprinting II. Resultados. Todos los aislamientos se relacionaron con el clon 19-Colombia5 y se agruparon en el patrón electroforético A con 17 subtipos. El patrón A se estableció en 32 aislamientos (38,6 por ciento), el A8 en 18 (21,7 por ciento) y el A5 en 10 (12 por ciento), los 15 patrones restantes agruparon los otros 23 aislamientos. Los 34 aislamientos resistentes a tetraciclina y cloranfenicol mostraron relación con los patrones electroforéticos A (n = 32), A16 (n = 1) y A28 (n = 1), caracterizados, al igual que el clon, por presentar una banda de 340 Kb. Conclusión. Estos resultados muestran la circulación continua en el país de aislamientos de S. pneumoniae serotipo 5 genéticamente relacionados con el clon 19-Colombia5.

Streptococcus pneumoniae: evolución de los serotipos y los patrones de susceptibilidad antimicrobiana en aislamientos invasores en 11 años de vigilancia en Colombia (1994 –2004) / Streptococcus pneumoniae: evolución de los serotipos y los patrones de susceptibilidad antimicrobiana en aislamientos invasores en 11 años de vigilancia en Colombia (1994 –2004)

Introducción. Streptococcus pneumoniae es una las principales causas de morbilidad y mortalidad en niños y adultos en el mundo. Objetivo. Realizar un análisis de los datos de la vigilancia por el laboratorio de los aislamientos invasores de S. pneumoniae recuperados entre 1994 y 2004. Materiales y métodos. Se empleó la información de los aislamientos invasores de S. pneumoniae recibidos en el Grupo de Microbiología del Instituto Nacional de Salud durante la vigilancia de meningitis bacteriana aguda e infección respiratoria aguda entre 1994 y 2004. Los aislamientos contaban con datos epidemiológicos, serotipo, patrones de susceptibilidad antimicrobiana y algunos con tipificación molecular. Resultados. Se analizaron los datos de 2.022 aislamientos procedentes de 120 hospitales de diferentes regiones del país, recuperados principalmente de hemocultivos (50,7 por ciento) y líquido cefalorraquídeo (42 por ciento). Los serotipos más importantes fueron el 14, 6B, 23F, 1, 5, 6A, 19F, 18C y 9V, los cuales corresponden al 83,6 por ciento en niños menores de 6 años, al 74,0 por ciento en el grupo de 6 a 14 años y al 61,4 por ciento en mayores de 14 años. El 29,8 por ciento de los aislamientos presentó susceptibilidad disminuida a la penicilina (SDP), 44,3 por ciento a trimetoprim-sulfametoxazol, 32,4 por ciento a tetraciclina, 8,2 por ciento a cloranfenicol, 3,8 por ciento a eritromicina; todos fueron sensibles a vancomicina y el 13 por ciento fue multirresistente. Se tipificaron 602 aislamientos con SDP, de los cuales 27 (4,5 por ciento)se relacionaron con el clon 1-España23F, 38 (6,3 por ciento) con el clon 2-España6B, 301 (50 por ciento) con el 3- España9V y 75 (12,5 por ciento) con el clon 26-Colombia23F, además, los 138 aislamientos con tipo capsular 5 se relacionaron con el clon 19-Colombia5. Conclusiones. Los resultados proporcionan información básica necesaria para el diseño e implementación de estrategias para la prevención de la enfermedad neumocócica en nuestro país.